选择素基因单核苷酸多态性与IgA肾病的关联.

时间
2008-12-09

虽然为阐明IgA肾病(IgAN)的遗传背景,各国研究者已付出了巨大的努力,但是与其发病机理相关的遗传因素尚未完全了解。

为此,日本东京大学医学研究所人类基因组中心的Takei T及其同事研究了E-选择素和L-选择素基因的单核苷酸多态性与IgAN之间的相关性。

他们根据染色体1q24-25选择素基因簇单核苷酸多态性(SNPs)的连锁不平衡,设计了病例-对照相关性研究,结果发现E-选择素基因有2个SNPs(SELE8和SELE13)、L选择素基因有6个SNPs(SELL1、SELL4、SELL5、SELL6、SELL10和SELL11),而这些SNPs与日本IgAN患者显著相关。所有的8个SNPs都处于近完全连锁不平衡。

SELE8和SELL10引起的氨基酸替代包括His被替代为Tyr(χ2=9.02,P=0.0026,OR=2.73[95%CI:1.38--5.38])以及Pro被替代为Ser(χ2=17.4,P=0.000031,OR=3.61[95%CI:1.91--6.83])。SELL1可影响L-选择素基因启动子活性(χ2=19.5,P=0.000010,OR=3.77[95%CI:2.02--7.05])。这三个基因位点的TGT单倍型与IgAN显著相关(χ2=18.67,P=0.000016,OR=1.88[95%CI:1.41--2.51])。

Takei T等总结认为,选择素基因的这8个SNPs可用于筛选易感IgAN表型的人群,这种IgAN表型可能涉及间质浸润。